沼气发酵也是一个造肥过程，原料中保留下来的氮磷钾是植物生长所需的营养元素，因此，沼液是很好的有机肥。同时沼液中留存有大量的氨基酸、B族维生素、各种水解酶、植物激素、对病虫害有抑制作用。
  1、沼液叶面施肥。取大换料后至少至少产气两个月以上的沼液，在沼气发酵池外储存5天后，按1：（1～3）的比例兑水喷雾。
  2、防治韭葱蒜地下根蛆。取大换料后至少至少产气两个月以上的沼液，在沼气发酵池外储存5天后，按1:1的比例兑水灌根，对根蛆的防治效果很好。
  3、防治蔬菜根部病害。取大换料后至少至少产气一个月以上基友具有较强氧化杀菌作用的沼液，抽出后直接随水冲施到土壤中，每亩3～5m2, 对蔬菜根腐病、枯萎病、根蛆和根节线虫等根部病虫害都有非常理想的防治效果。
  4、提高植物抗逆性。沼液中含有多种水溶性养分，是一种速效的液体肥，用于蔬菜根灌和叶面喷施，有强壮植株，提高植株抗逆性的作用。
  5、注意问题。沼液灌根时，由于植株器官的承受能力和产气物料的鲜熟成都不同，在沼气发酵池外储存5天后，兑水一般为1～3倍，也可以先实验后再确定兑水量。